Селище засновано в 1659 році переселенцями з Правобережної України, що тікали сюди від гніту польських феодалів.

За даними на 1864 рік у казеному селі Замостянської волості Зміївського повіту, мешкало 732 особи (365 чоловічої статі та 367— жіночої), налічувалось 141 дворове господарство, існувала православна церква.

Станом на1914рік кількість мешканців зросла до 1809 осіб.

Селище постраждало внаслідок геноциду українського народу, проведеного урядом СССР в 1932—1933 роках, кількість встановлених жертв— 116 людей.

В 1938 році відбулася зміна статусу на селище міського типу.

Селище міського типу Зідьки розташоване на правому березі річки Сіверський Донець в місці впадання в неї річки Мжа, вище за течією примикає до села Черемушне, нижче за течією примикає до міста Зміїв. Примикає до селища Бутівка. Через селище проходить залізниця, станції Зідьки, Геніївка і Зміїв. Забезпечується підвезення робочих змін до Харкова та інших міст приміськими електропоїздами.